中国科学院物理研究所品牌，图案为研究所英文字母IP缩写,造型为一昂首挺胸的“人”或“中”字;象征研究所提倡科学研究的“自由、创新”精神。表现物理所人奋发向上的精神风貌、勇于创新的精神和建设具有中国特色的国际一流凝聚态物理研究基地的决心。所徽整个徽标呈正圆形。圆的外层上半部为中文“中国科学院物理研究所”，对应的下半部为英文“Institute of Physics CAS”。图案中心以物理学（Physics）的英文首字母“P”为核心，同时也象征该所是在中国科学院领导下的组织，图案中心右下方为该所建立时间。
中国科学院理论物理研究所品牌，标识整体使用理论物理所英文缩写“ITP”三个英文字母。 2. 标识体现理论物理所团结、向上的精神。 3. 标识体现理论物理所1978年建立时间。 4. 标识具有明显的中国科学院所属研究所的特征。
中国科学院国家空间科学中心品牌，国家空间科学中心标识，以其芙文缩写NSSC为图文内容，以中国传统书法艺术为表现形式，以象征深广宇宙空间的蓝色作为标准色。标识内敛厚重，历久耐占，易于识别记忆，应月扩展性强，契合当代设计趋势。 标识象征国家空间科学中心人团结一致，面向国家战略需求，自向世界空间科学前沿，以建成中国核心、国际著名的总体性研究机构为目标，引领空间科学发展，带动空间技术创新，矢志树起中国人铸就的人类探索太空新丰碑。
中国科学院西双版纳热带植物园品牌，国家空间科学中心标识，以其芙文缩写NSSC为图文内容，以中国传统书法艺术为表现形式，以象征深广宇宙空间的蓝色作为标准色。标识内敛厚重，历久耐占，易于识别记忆，应月扩展性强，契合当代设计趋势。 标识象征国家空间科学中心人团结一致，面向国家战略需求，自向世界空间科学前沿，以建成中国核心、国际著名的总体性研究机构为目标，引领空间科学发展，带动空间技术创新，矢志树起中国人铸就的人类探索太空新丰碑。
中国科学院微生物研究所品牌，中国科学院微生物研究所所徽该标识结构严谨、稳重大气。体现微生物所探索永无止境，不断发展超越的精神。标识整体以方圆结构为造型，外圆与中国科学院院徽外形相同，突出微生物所隶属于中国科学院，六边形代表该所属于中科院六个学部之一的生物学部。以DNA双螺旋加底座，巧妙构成显微镜的图案，体现该所的基本学科特点，强调微生物研究已进入分子水平。“1958”示意该所的成立时间，“C·A·S”为中国科学院的英文缩写。深蓝色代表高科技，也象征该所在生物科技领域勇于攀登、开拓前进的完整理念。
中国科学院地理科学与资源研究所品牌，整个徽标呈正圆形。圆的外层上半部为中文“中国科学院地理科学与资源研究所”，对应的下半部为英文“INSTITUTE OF GEOGRAPHIC SCIENCES AND NATURAL RESOURCES RESEARCH，CAS”（中国科学院地理科学与资源研究所）。图案中心以旋转的“G”、“地球”、“绿叶”等为主要元素，象征地质学（GEOGRAPHIC）和自然资源学（NATURAL RESOURCES），象征两大一级学科的紧密结合。
中国科学院声学研究所品牌，整个徽标呈正圆形。所徽以具有中国声学研究特色的永乐大钟和白暨豚为主要元素，配以相互交融的水面与空气中的声波波纹为背景，既体现了中国声学学科发展的悠久历史和现代成就，也标志着声学所肩负的发展中国声学事业，并代表国家参与国际声学研究竞争的历史使命。
中国科学院半导体研究所品牌，研究所所徽是汉字“半导”组合行程的图案，红色的1960是研究所创建年份。所徽的外环上方是研究所英文名称，下方中文名称。所徽整体以寓意严谨、科学的蓝色为主色调。
中国科学院青海盐湖研究所品牌，以方块的盐田组合，构成一个向上的箭头，寓意着研究所所不断的规划、创新和发展精神。蓝色代表湖水，绿色代表生态与和谐。其中四块蓝色方块代表四大湖区（青海，西藏，新疆和内蒙），亦代表我所四个专业（无机，分析，化工和地化），两个绿色方块代表我所的两个研究部门（工程中心和重点实验室）。整体标志体现大气、积极、团结和拼搏的研究精神。
中国科学院国家授时中心品牌，国家授时中心形象标识标准色为红蓝色两色。标识图案由国家授时中心英文缩写字母NTS(红色)C（蓝色）组成。主体是字母C（蓝色）变形的日晷形象，具有时间、宇宙有关的日、月、时和时钟的含义，指向太空的箭头（红色）有明确、坚定向上的方向感，整个图形具有强烈的动感，象征时间的流动和永恒，体现国家授时中心科研式作的性质和特点，清晰表述了测时、守时和授时工作这一系统工程的深刻内涵。正式场合、正式出版物上应用中心形象标识，原则上不得使用其它颜色。在应用辅助色时必须符合规定标准。
中国科学院海洋研究所品牌，标识上方文字“中国科学院海洋研究所”选摘自中国科学院第一任院长郭沫若的手书体，中间的“IOCAS”字母组合是研究所的英文缩写（Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences），中间类似半圆形图案代表地球，寓意重点研究领域隶属地球科学研究；也可代表太阳，寓意海洋研究所的未来发展将如冉冉旭日，海洋所人精诚团结、踏实敬业,开拓创新、和谐共进，研究所的明天会和谐、科学和可持续发展。左下方的交叉曲线代表了浩瀚的海洋,下方的数字1950年表明研究所创建时间是1950年.整体色彩以蓝色为主，显现海纳百川，千流所归的博大浩瀚。 整体设计稳重、大方、和谐，体现海洋所坚持面向国家对海洋资源可持续利用和海洋生态环境可持续发展的战略需求，坚持面向国际海洋科学前沿，以把研究所建成具有国际一流水平的海洋科学研究基地、高层次海洋科技优秀人才的培养基地和促进我国海洋高新技术发展的基地为目标。
中国科学院自动化研究所品牌，整个标志由“IA”的形变而成，利用三角的构图形式，强调了稳定感，突出顶天立地之意（两个使命）与强劲上升的视觉感。中心的红色圆点阐释了我们的能量、活力与热情，加之粗细不同变化的蓝色圆环，体现了时空性和历史感（两弹一星）。 整个造型表达了管理的灵活性与全球同步快速发展的完整理念。
中国科学院上海技术物理研究所品牌，研究所标识构图采用三角形，使整个画面既稳定坚固，又升腾向上。三角形寓意本所是集基础及应用基础研究、应用研究及重大工程任务、开发研究及高新技术产业于一体的综合性研究单位，三大块结构相互关系，相互支撑，互为促进，共同发展。标识形成了蓝天背景衬托下的银白色航天飞机，寓意本所主要从事的是国家航天高科技领域的研究。
中国科学院电工研究所品牌，电工所新标志主体为一个象征着地球的圆形，“电”的英文开头字母”e“飞旋其上，形象地传达着电工所全球观和国际化的发展理念。 一条白色的光迹自上而下地围绕地球飞过，既传达了“电”运动的概念，这条光迹又巧妙地与字母“e”组成了汉字“电”的形态，将中科院电工所的行业特征鲜明地加以彰显。 ”地球“左侧为”森林绿“，右侧为”海洋兰“，由左向右的动感演绎出电工所为绿色全球做贡献的崇高理念。 标志整体简洁、舒展，定位准确，形象传达了电工所立足”电工“，面向世界，勃勃向上的创新精神。
中国科学院山西煤炭化学研究所品牌，红黑相嵌的六边形代表炭分子的基本单元苯环，黑色象征煤炭，红色象征煤的洁净转化，红黑双色斜向排列表现一种铿锵的力度和永远向前的精神。
中国科学院亚热带农业生态研究所品牌，国科学院亚热带农业生态研究所所徽由所英文名缩写字母“ISA”变形组成，体现了研究所的“联合”、“团结”、“向上”精神；地球背景意喻研究所的国际化趋势，表示了具有国际影响，国内一流的办所宗旨；椭圆中二道空白线，代表了亚热带地理位置，所徽中红色、黄色体现了亚热带红黄壤的区域特色；绿色紧扣“农业”主题，象征希望与生机。
中国科学院昆明动物研究所品牌，中国科学院昆明动物研究所所徽整体以绿色为主，代表其尊敬自然，爱护环境的的科学态度。所徽外圈分别由研究所的中英文名组成，内圈为一个猴子的图像，一方面表现其关爱动物，与动物和谐相处的理念，另一方面，表现出其研究的方向主要在动物领域。 中国科学院昆明动物研究所直属于中国科学院，是中国生物多样性演化、保护与可持续利用领域的综合性研究机构。
中国科学院昆明植物研究所品牌，1、该所所徽外形呈圆环型，圆的外圈为研究所的中英文，内圈为植物造型，一方面表现出研究所的主要研究对象为植物，另一方面表现出该所尊重自然，与自然和谐相处的理念。 2、所徽外圈为绿色，内圈为绿色，生动将植物的颜色搭配，突出其对植物的关注。 3、内圈植物下的数字1938，表现出该所的成立时间为1938年。
中国科学院微电子研究所品牌，中国科学院微电子研究所所标涉及创意说明：标志以菱形为主体充分体现出研究所团队的严谨与理性，同时相叠的菱形代表了微电子产品，向右形成的两个充满力量的箭头，表明了研究所在微电子领域中勇于探索、不断钻研与开拓的精神。箭头向细变化，表现了产品向着更细、更精发展的物理特点。标志中心快速运动的线条，是微电子技术飞速发展的写照，表现出该所要在不断发展中求平稳、求创新的精神。
中国科学院理化技术研究所品牌，主体图案由中国科学院理化技术研究所的英文缩写TIPC组成。其中T由纵横两组径赛跑道变形而成，寓意科学与技术的相互促进，物理与化学的协同发展，国家战略需求与国际科学前沿的有机结合；表明理化技术研究所在技术创新与发展的目标定位下，奋发有为、开拓前进的信念与追求。
中国科学院地球环境研究所品牌，所徽的设计首先突出了研究所的科学目标：“从地球整体环境系统（大气、大陆、海洋等）和圈层（岩石圈、水圈、生物圈和大气圈）各因子相互作用和耦合过程的角度，在全球和区域层次上开展大陆环境系统不同尺度时空变迁规律和机制的研究”，因此所徽由三个圆环组成，象征着地球不同圈层和不同子系统的相互作用和耦合过程，组成的圆圈代表地球，其中外圈为“中国科学院地球环境研究所，Institute of Earth Environment, CAS”，即研究所中英文全称。圈内由一条逐步上升的曲线连接，表示研究所不断发展，研究水平的不断攀升，曲线的4个上升阶梯象征着我国现代3大地貌阶梯和周边海域，意指：研究所以东亚大陆环境为主要研究对象；曲线同时也是各种记录（地质、生物和历史文献）的科学表述形式，表明研究所强调记录，注重实验的科学学风；曲线的波浪起伏，象征着攀登科学道路的艰辛；同时曲线的波浪上升暗示着只有意志坚定、不畏困难的人才能达到科学的顶峰，并且象征着研究所将不断地从一个辉煌走向另一个辉煌。 研究所新设计的所徽，浓缩着研究所原有的十数年的研究积淀和未来研究的构想，成为全所职工都普遍认同的新标志，这将进一步激发每一位科研人员爱所的感情，增加其作为研究所一分子的自豪感，激励他们在科学道路上取得更优异的成绩。
中国科学院过程工程研究所品牌，新的所徽涵盖过程工程研究所英文缩写"IPE"，体现化学、物理、生物转化及学科交叉，以"IPE"组成钥匙形状寓意解决过程工业中从实验室成果向产业化过渡的瓶颈问题，背景由绿到蓝过渡象征"绿地蓝天"，具有发展的无限空间和环境生态可持续发展。
中国科学院西北生态环境资源研究院品牌，中国科学院西北生态环境资源研究院的院徽从logo整体造型来看，其中是1955年为沙坡头沙漠研究试验站建站日期，也是文献情报中心（原中国科学院兰州图书馆）成立时间，即1955年为西北研究院各单元往上追溯的最早建立日期，表明了西北研究院历史悠久、底蕴深厚﹔年份下方以书的造型为背景，既代表着文献情报中心，又代表着那些扎根西部、不畏艰险、乐于奉献、追求卓越的知识分子和的科研工作者。 从logo整体造型来看，内圈共有5种颜色代表西北研究院由5个单元组建而成。上方蓝色区域代表高原大气中间的白色区域代表冰川冻土；下方绿色区域代表着寒区旱区生态与农业，条纹状取自盐湖造型，黄色的区域代表沙漠，褐色的部分代表油气地质。设计中不同的颜色基本涵盖了该院的研究方向，如冰川、冻土、沙漠、高原生态、盐湖、油气地质、高原大气和资源环境信息等。 从logo深层寓意来看，下方黄色区域中的5个小区域代表盐湖，也代表西北研究院的5个单元，条纹状既像铁路又像阶梯，“铁路”寓意着该院在青藏铁路和包兰铁路建设中所取得的突出成就，获得2项国家科技进步特等奖，“阶梯”既寓意着书籍是人类进步的阶梯，代表文献情报中心，同时也寓意着西北研究院整合后在新的起点上，围绕服务国家“丝绸之路经济带”和西部大开发战略，进一步攻坚克难、团结协作、继往开来、勇攀高峰，向着更高、更远、更深、更广的方向发展。
中国科学院西安光学精密机械研究所品牌，中国科学院西北生态环境资源研究院的院徽从logo整体造型来看，其中是1955年为沙坡头沙漠研究试验站建站日期，也是文献情报中心（原中国科学院兰州图书馆）成立时间，即1955年为西北研究院各单元往上追溯的最早建立日期，表明了西北研究院历史悠久、底蕴深厚﹔年份下方以书的造型为背景，既代表着文献情报中心，又代表着那些扎根西部、不畏艰险、乐于奉献、追求卓越的知识分子和的科研工作者。 从logo整体造型来看，内圈共有5种颜色代表西北研究院由5个单元组建而成。上方蓝色区域代表高原大气中间的白色区域代表冰川冻土；下方绿色区域代表着寒区旱区生态与农业，条纹状取自盐湖造型，黄色的区域代表沙漠，褐色的部分代表油气地质。设计中不同的颜色基本涵盖了该院的研究方向，如冰川、冻土、沙漠、高原生态、盐湖、油气地质、高原大气和资源环境信息等。 从logo深层寓意来看，下方黄色区域中的5个小区域代表盐湖，也代表西北研究院的5个单元，条纹状既像铁路又像阶梯，“铁路”寓意着该院在青藏铁路和包兰铁路建设中所取得的突出成就，获得2项国家科技进步特等奖，“阶梯”既寓意着书籍是人类进步的阶梯，代表文献情报中心，同时也寓意着西北研究院整合后在新的起点上，围绕服务国家“丝绸之路经济带”和西部大开发战略，进一步攻坚克难、团结协作、继往开来、勇攀高峰，向着更高、更远、更深、更广的方向发展。
中国科学院成都生物研究所品牌，中国科学院成都生物研究所所徽由生物两字演变而来。
中国科学院新疆生态与地理研究所品牌，中国科学院新疆生态与地理研究所所徽由S、D两个字母组合，代表所名生态（Shengtai）与地理（Dili）；上绿下蓝并加叶片，象征地球与生物圈、植物是生态系统的初级生产者、生命与水密不可分的关系。其文化内涵是：研究所以绿洲生态过程与生态系统管理研究为中心的定位；研究工作中生态过程与地理格局研究的高层面、大时空耦合；西部大开发以生态环境保护和建设为根本，推进绿洲化，逆转荒漠化。
中国科学院分子植物科学卓越创新中心品牌，标志以绿色为主色调，象征着生命和蓬勃向上的力量。标志整体圆形设计，体现了科研与社会的和谐融合。对称的造型层次分明，给人以庄重之感。标志中心，似一朵抽象的含苞待放的花朵，代表着植物科学研究；又似一只小虫，代表着昆虫科学研究；同时也喻示着植物和生态环境的和谐；花朵造型似上海市市花白玉兰，体现了研究所立足上海、放眼世界的地域文化特色。四周以旋转的叶子为衬托，喻示DNA双螺旋结构，体现分子生物学对当代各学科研究的支撑；又似小的细菌，展现了我所微生物学的研究特色。
中国科学院武汉植物园品牌，1、水杉是中国特有孑遗植物，国家一级重点保护植物，原产地在华中地区。武汉植物园园徽以水杉的树型进行抽象化处理，寓意为该园以华中地区植物为研究主体。树型着浅绿、绿、黄三种颜色，主要有二层含义：（1）从物种的角度来说，寓意华中地区物种资源丰富；（2）从植被的角度来说，植被季相变化多，寓意华中地区植被类型多。 2、树型浅绿部分抽象表现为英文大写字母“W”、绿色部分为英文大写字母“B”、黄色部分为英文大写字母“G”，三个英文大写字母组合成中国科学院武汉植物园的英文缩写。在树型下方，为由3个“C”型组成的白色水印，周围为绿色包围，主要有三层寓意：（1）体现了地处千湖之省湖北省的武汉植物园在水生、湿地植物和流域生态等方面的研究特色，通过研究，要让湖北乃至华中地区“山青水秀”。（2）水印中3个英文字母“C”型，均为英文单词“center”的第一个字母，意味着该园以“植物资源收集与保护、科学研究与开发利用、科学知识传播和普及”三大功能为中心，为中国社会经济的可持续发展和生物经济规模产业化做出重要贡献。
中国林业科学研究院林产化学工业研究所品牌，林化所标识由绿、白两色相间构成，上有林化所英文缩写：ICIFP。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所品牌，所标外围为中英文对照的所名与英文简称，标志主体以和平鸽与麦穗的造型为结合体，采用扁平的“点线”进行设计，延伸出完整的“面”，象征着世界之间多元合作和融合并进，表达了中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国际科研事业的紧密合作、共同进步和可持续发展的愿景。
自然资源部天津海水淡化与综合利用研究所品牌，自然资源部天津海水淡化与综合利用研究所所徽由红蓝绿三色和英文ISDMU演变组成。
中国科学院上海营养与健康研究所品牌，自然资源部天津海水淡化与综合利用研究所所徽由红蓝绿三色和英文ISDMU演变组成。
中国科学院华南植物园品牌，自然资源部天津海水淡化与综合利用研究所所徽由红蓝绿三色和英文ISDMU演变组成。
中国科学院青藏高原研究所品牌，整个徽标呈正圆形。圆的外层上半部为中文“中国科学院青藏高原研究所”，对应的下半部为英文“Institute of Tibetan Plateau Research Chinese Academy of Sciences”（中国科学院青藏高原研究所）。图案以冰川、河流等为主要元素和中国科学院青藏高原研究所的英文简写ITP构成了中国科学院青藏高原研究所的形象标识。
农业农村部沼气科学研究所品牌，农业农村部沼气科学研究所形象标识为同心圆设计，外环为研究所中英文全称环绕，内环中心为“沼气”状象形物体，在外环绕着线条状小圆环，象征着研究所“沼气研究”的属性。
中国热带农业科学院香料饮料研究所品牌，中国热带农业科学院香料饮料研究所统一使用中国热带农业科学院院徽。院徽中间是绿色圆形背景，象征热科院的研究特色。在英文简称“CATAS”及建院时间1954字样的上方，是两个斜对称的蓝色弧带环绕着中国热带地区地图的图案，地图置于北半球经纬网之上。
中国林业科学研究院热带林业研究所品牌，中国林业科学研究院热带林业研究所形象标识由同心圆组成，外部为绿色圆环配有白色研究所中英文全称；内部为“热带林业”简笔图像，寓意研究所的属性。
中国科学院南京土壤研究所品牌，1、圆内由“ISSCAS”中的三个“S”组成，如腾飞的大鹏，一气呵成，喻指土壤事业蒸蒸日上； 2、中间反白部分是“Soil Science”中的两个“S”,指明了我所主要研究内容－土壤科学； 3、上半部分自然绿和下半部分土黄色密不可分，暗示黄土地上的盎然生机，背景为淡蓝，喻指大气圈，又似海洋。 这样就把我所全部研究内容：土壤、大气、水、植物等包容在里面。
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心品牌，生化与细胞所标识是其英文简称“CENCSS”的艺术图案。
中国科学院上海微系统与信息技术研究所品牌，中国科学院上海微系统与信息技术研究所，英文名称Shanghai Institute of Microsystem and Information Technology ，简称SIMIT。 从形状上看，所标是用四条弧线叠加构成的动感形态，象征着有序的结合、信息波的无限扩展，给人有无限的想象空间，突出体现了上海微系统所科研人员开拓进取、乐于探索、勇于创新、不断攀登科学高峰的理想追求。四条弧线表示作为中科院高技术研究所的科研人员，在社会主义和谐社会建设进程中，始终明确自己的定位、发展目标及应有的贡献。 从色彩上看，蓝色是指蔚蓝的天空和湛蓝的海洋，表示上海微系统所科研人员在科学的殿堂里上天搏击、下海遨游、乘风破浪、不断攀登高科技领域尖端科学的气魄。蓝色又表示平和、朴实，反映出上海微系统所科研人员脚踏实地、严谨务实的科学精神。 从整体上看，整个设计体现了上海微系统所建所来凝聚出的“团结、高效、严谨、创新”八字所风，四条弧线的紧紧叠加和开放式的伸展，表示作为微系统与信息技术研究所的职工在从事科研活动中，团结协作、继往开来、与时俱进的精神风貌。色彩由深变浅，体现出了科研人员力求变革、努力探索科学奥秘的不懈追求以及一步一个脚印、循序渐进、扎实的工作态度。
中国科学院上海硅酸盐研究所品牌，中国科学院上海硅酸盐研究所所标的左侧为硅氧四面体分子结构图，标示着该所的研究方向；右侧的SICCAS字符为Shanghai Institute of Ceramics Chinese Academy of Sciences的缩写；Since 1928表示中国科学院上海硅酸盐研究所渊源于1928年成立的国立中央研究院工程研究所，历史悠久。 硬朗有序的线条体现了该所稳健发展，高效有序的特征。所标采用了理性的灰蓝色和明快的蓝绿色，象征着该所科学研究工作的严谨求实、科技人本主义以及国际化的特征。
中国科学院植物研究所品牌，标识中三角形的两条边代表宏观与微观两个研究领域，底边代表大地。中间的植物代表植物所由4个研究中心和一个植物园组成，三角形及其中植株代表高新技术。
中国安全生产科学研究院品牌，标志左右两边分别是齿轮和谷穗，分别代表着工人、农民，也代表工业和农业，概指一切生产行为。中间十字表示救护、保护、安全，上面印有安科院英文简称“CASST”。标志整体色调为绿色。
中国兽医药品监察所品牌，中国兽医药品监察所所徽的图案采用圆形彰显理性与自然，用绿色诊释关爱自然与生命，同时传达和反映出本机构的生机与活力。采用协调一致的绿色中、英文注明本所的全称，用绿色五角星号将其上下分开，形成白底绿字的外环。所徽的内圆图案分别由长城、麦穗、眼睛、蛇杖等图案组成。在眼睛瞳孔的上部、中轴线蛇杖的顶端，有一颗星光四射的五角星，它使眼睛目光更加犀利、明快而炯炯有神，象征着可以看到从上到下，贯穿全国各地的每一个角落。眼睛的设计喻意颇深。整个眼白采用绿色为基底色，上眼皮外用白色粗线描绘出长城的剪影，同时有捍卫的寓意;下眼皮处亦采用白色来显现出麦穗的图案，提示着农业是在长城之下，即中国的农业，以象征性显示本所隶属国家农业部。在眼睛的瞳孔部分，用白色圆环圈界出来，运用国际上通用的西方人医的标志性蛇杖图案，设置在中轴线上，成功地把眼睛撑开，从而睁大了眼睛。喻意为在全国人民的瞩目下，全所职工努力奋斗，认真执行国家和人民赐予的兽医药品监察职责。为了区别于西方人医，瞳孔部位采用蓝色作底色，包括这条蛇的眼睛，表明这蛇杖是指兽医的。
中科院数学与系统科学研究院品牌，标识是数学勾股弦定理的一个几何证明，其中包含四个直角三角形，意寓数学院由四个研究所合并组成，同时象征研究院知识创新的四个目标。图形方方正正，体现了研究院工作者的稳重求实、创新精神和开展应用工作的能力。
中国科学院自然科学史研究所品牌，所徽设计创意来自中国的《周髀算经》。圆形代表天，方形代表大地。一条水平线假设为地平，两根立杆用于测量三角形顶角处的太阳之高度。
中国科学院植物生理生态研究所品牌，标志以绿色为主色调，象征着生命和蓬勃向上的力量。 标志整体圆形设计，体现了科研与社会的和谐融合。对称的造型层次分明，给人以庄重之感。 标志中心，似一朵抽象的含苞待放的花朵，代表着植物科学研究；又似一只小虫，代表着昆虫科学研究；同时也喻示着植物和生态环境的和谐；花朵造型似上海市市花白玉兰，体现了研究所立足上海、放眼世界的地域文化特色。 四周以旋转的叶子为衬托，喻示DNA双螺旋结构，体现分子生物学对当代各学科研究的支撑；又似小的细菌，展现了我所微生物学的研究特色。
中国科学院化学研究所品牌，主体由一个圆形图案构成，象征化学所的团结和协作，也表示分子和原子的轨道，凸显化学学科的特点。2. 中英文所名环绕着一个大写的英文字母“C”,代表化学(Chemistry),中国(China)和中心（Center）,寓意为化学是自然科学的中心学科,化学所要成为中国化学研究的中心,成为国际一流的研究所。
中国科学院成都山地灾害与环境研究所品牌，主体由一个圆形图案构成，象征化学所的团结和协作，也表示分子和原子的轨道，凸显化学学科的特点。2. 中英文所名环绕着一个大写的英文字母“C”,代表化学(Chemistry),中国(China)和中心（Center）,寓意为化学是自然科学的中心学科,化学所要成为中国化学研究的中心,成为国际一流的研究所。
中国科学院动物研究所品牌，整体标识以动物研究所英文缩写"IOZ"的变形为主体，也突出了“动”字的变形，上方圆点与下侧半开O型图案表现了天地之合，中央Z型图案意喻生命科学漫长探索之路，延升之剑尾寓意科学高峰永无止境；标识整体色彩以蓝色为主，显现海之博大、天之浩瀚，天地间中国科学院动物研究所似雄鹰展翅搏击长空、如巨龙盘踞蓄势待发；红色闪光圆点表达了动物研究所的活力和热情；整体设计体现动物研究所探索、追求、发展、超越的完整理念。
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