中国科学院武汉病毒研究所品牌，研究所所徽是由其英文名称中W、I、V的艺术图案构成，主色调为绿色，中间部分为紫色。图案上方是1956为研究所的建立时间。
中国科学院兰州高原大气物理研究所品牌，中国科学院兰州高原大气物理研究所的院徽从logo整体造型来看，上方蓝色区域代表高原大气中间的白色区域代表冰川冻土；下方绿色区域代表着寒区旱区生态与农业，条纹状取自盐湖造型，黄色的区域代表沙漠，褐色的部分代表油气地质。设计中不同的颜色基本涵盖了该院的研究方向，如冰川、冻土、沙漠、高原生态、盐湖、油气地质、高原大气和资源环境信息等。和包兰铁路建设中所取得的突出成就，获得2项国家科技进步特等奖，“阶梯”既寓意着书籍是人类进步的阶梯，代表文献情报中心，同时也寓意着西北研究院整合后在新的起点上，围绕服务国家“丝绸之路经济带”和西部大开发战略，进一步攻坚克难、团结协作、继往开来、勇攀高峰，向着更高、更远、更深、更广的方向发展。
中国科学院上海冶金研究所品牌，从形状上看，所标是用四条弧线叠加构成的动感形态，象征着有序的结合、信息波的无限扩展，给人有无限的想象空间，突出体现了中国科学院上海微系统与信息技术研究所科研人员开拓进取、乐于探索、勇于创新、不断攀登科学高峰的理想追求。四条弧线表示作为中科院高技术研究所的科研人员，在社会主义和谐社会建设进程中，始终明确自己的定位、发展目标及应有的贡献。 从色彩上看，蓝色是指蔚蓝的天空和湛蓝的海洋，表示中国科学院上海微系统与信息技术研究所科研人员在科学的殿堂里上天搏击、下海遨游、乘风破浪、不断攀登高科技领域尖端科学的气魄。蓝色又表示平和、朴实，反映出中国科学院上海微系统与信息技术研究所科研人员脚踏实地、严谨务实的科学精神。 从整体上看，整个设计体现了中国科学院上海微系统与信息技术研究所建所来凝聚出的“团结、高效、严谨、创新”八字所风，四条弧线的紧紧叠加和开放式的伸展，表示作为微系统与信息技术研究所的职工在从事科研活动中，团结协作、继往开来、与时俱进的精神风貌。色彩由深变浅，体现出了科研人员力求变革、努力探索科学奥秘的不懈追求以及一步一个脚印、循序渐进、扎实的工作态度。
中国科学院上海药物研究所品牌，所标识以象征生命的绿色为基础，以研究所化学、生物学两大学科以及实验技术为要素，以中国书法的用笔为表现形态，主要含义： 1、构图两侧呈环形运动状，象征在药物研究领域化学与生物学的不断发展与融合。 2、环形两叶互补，叠化出烧杯形状，并在中央形成水滴状，代表了实验技术，寓意药物研究有效成分的发现与研究。 3、用中国书法的流畅与动感构成图案，象征中国传统中药与现代科学技术的结合以及提高我国自主知识产权的创新药物研究的信心与能力。 4、以抽象的构图，赋予标识丰富的内涵与想象，与药物所悠久的历史相呼应，且简洁而富有时代感，具有较强的个性。
中国科学院成都山地灾害与环境研究所品牌，主体由一个圆形图案构成，象征化学所的团结和协作，也表示分子和原子的轨道，凸显化学学科的特点。2. 中英文所名环绕着一个大写的英文字母“C”,代表化学(Chemistry),中国(China)和中心（Center）,寓意为化学是自然科学的中心学科,化学所要成为中国化学研究的中心,成为国际一流的研究所。
中国科学院植物生理生态研究所品牌，标志以绿色为主色调，象征着生命和蓬勃向上的力量。 标志整体圆形设计，体现了科研与社会的和谐融合。对称的造型层次分明，给人以庄重之感。 标志中心，似一朵抽象的含苞待放的花朵，代表着植物科学研究；又似一只小虫，代表着昆虫科学研究；同时也喻示着植物和生态环境的和谐；花朵造型似上海市市花白玉兰，体现了研究所立足上海、放眼世界的地域文化特色。 四周以旋转的叶子为衬托，喻示DNA双螺旋结构，体现分子生物学对当代各学科研究的支撑；又似小的细菌，展现了我所微生物学的研究特色。
中科院数学与系统科学研究院品牌，标识是数学勾股弦定理的一个几何证明，其中包含四个直角三角形，意寓数学院由四个研究所合并组成，同时象征研究院知识创新的四个目标。图形方方正正，体现了研究院工作者的稳重求实、创新精神和开展应用工作的能力。
中国安全生产科学研究院品牌，标志左右两边分别是齿轮和谷穗，分别代表着工人、农民，也代表工业和农业，概指一切生产行为。中间十字表示救护、保护、安全，上面印有安科院英文简称“CASST”。标志整体色调为绿色。
中国科学院上海硅酸盐研究所品牌，中国科学院上海硅酸盐研究所所标的左侧为硅氧四面体分子结构图，标示着该所的研究方向；右侧的SICCAS字符为Shanghai Institute of Ceramics Chinese Academy of Sciences的缩写；Since 1928表示中国科学院上海硅酸盐研究所渊源于1928年成立的国立中央研究院工程研究所，历史悠久。 硬朗有序的线条体现了该所稳健发展，高效有序的特征。所标采用了理性的灰蓝色和明快的蓝绿色，象征着该所科学研究工作的严谨求实、科技人本主义以及国际化的特征。
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心品牌，生化与细胞所标识是其英文简称“CENCSS”的艺术图案。
中国科学院测量与地球物理研究所品牌，研究所所徽以代表科学的深蓝色为主色调。所徽由经纬线构成的地球和研究所英文简称IGG构成，与研究所的研究内容和方向相对应，凸显研究所的办所特色。
中国科学院上海光学精密机械研究所品牌，标识以圆形为基本型，体现上海光机所老中青科学家和全所职工五十年来同心同德、团结奋斗，攀登科学高峰不断成熟的象征（追求完整、成就圆满）。 标识以兰色为基调，象征科学研究严谨严密的文化氛围，体现上海光机所海纳百川的开放精神。 标识图案的三个部分均以光学单元平、凸和凹透镜构成，中间部分为抽象的谐振腔形状，它们有机组合在Optics的“O”中，意在表达上海光机所以“光学”（现代光学，光科学）为主要学科研究的特征内涵。 标识选择开放、变化的圆形，上部凸凹透镜相互倚靠，形成弯曲向上的空间，表示上海光机所不懈进取，引领向上的动态趋势；下部平实的光学材料，寓意坚实的光电子支撑技术和材料是上海光机所发展的基石。圆润秀丽的图形灵动，标志着上海光机所秉承传统光学领域的雄厚基础，胸怀开拓新兴科研领域的进取精神，构筑面向世界的现代光学研究所。
中国科学院长春应用化学研究所品牌，标识内涵：标识以苯环为基础设计要素，下方的“CIAC”为长春应用化学研究所的英文缩写。 标识中的椭圆是地球的造型，借以隐喻化学广阔的发展空间。聚拢和永续流动的态势极好地体现了应化所协力精进的团队精神和强劲的凝聚力。 椭圆内部的苯环呈上升趋势，下方有序的速度线使其具有一颗飞翔行星的速度、力量和辉煌，不仅象征应化所的活力、动力和创造力，也寓意着应化人积极进取、追求卓越的人生信念和搏击精神。苯环冲破椭圆的开放态势，打破了封闭式造型的刻板和单调，形象地表现了科学无止境的含义，更是应化人开放的科学理念的体现。 标识的基础色为“应化蓝”。蓝色代表严谨、科学、规范、求实，象征科学、诚信的治学精神，与应化所“应用化学，追求卓越”的核心理念相吻合。
中国科学院动物研究所品牌，整体标识以动物研究所英文缩写"IOZ"的变形为主体，也突出了“动”字的变形，上方圆点与下侧半开O型图案表现了天地之合，中央Z型图案意喻生命科学漫长探索之路，延升之剑尾寓意科学高峰永无止境；标识整体色彩以蓝色为主，显现海之博大、天之浩瀚，天地间中国科学院动物研究所似雄鹰展翅搏击长空、如巨龙盘踞蓄势待发；红色闪光圆点表达了动物研究所的活力和热情；整体设计体现动物研究所探索、追求、发展、超越的完整理念。
中国科学院化学研究所品牌，主体由一个圆形图案构成，象征化学所的团结和协作，也表示分子和原子的轨道，凸显化学学科的特点。2. 中英文所名环绕着一个大写的英文字母“C”,代表化学(Chemistry),中国(China)和中心（Center）,寓意为化学是自然科学的中心学科,化学所要成为中国化学研究的中心,成为国际一流的研究所。
中国科学院自然科学史研究所品牌，所徽设计创意来自中国的《周髀算经》。圆形代表天，方形代表大地。一条水平线假设为地平，两根立杆用于测量三角形顶角处的太阳之高度。
中国兽医药品监察所品牌，中国兽医药品监察所所徽的图案采用圆形彰显理性与自然，用绿色诊释关爱自然与生命，同时传达和反映出本机构的生机与活力。采用协调一致的绿色中、英文注明本所的全称，用绿色五角星号将其上下分开，形成白底绿字的外环。所徽的内圆图案分别由长城、麦穗、眼睛、蛇杖等图案组成。在眼睛瞳孔的上部、中轴线蛇杖的顶端，有一颗星光四射的五角星，它使眼睛目光更加犀利、明快而炯炯有神，象征着可以看到从上到下，贯穿全国各地的每一个角落。眼睛的设计喻意颇深。整个眼白采用绿色为基底色，上眼皮外用白色粗线描绘出长城的剪影，同时有捍卫的寓意;下眼皮处亦采用白色来显现出麦穗的图案，提示着农业是在长城之下，即中国的农业，以象征性显示本所隶属国家农业部。在眼睛的瞳孔部分，用白色圆环圈界出来，运用国际上通用的西方人医的标志性蛇杖图案，设置在中轴线上，成功地把眼睛撑开，从而睁大了眼睛。喻意为在全国人民的瞩目下，全所职工努力奋斗，认真执行国家和人民赐予的兽医药品监察职责。为了区别于西方人医，瞳孔部位采用蓝色作底色，包括这条蛇的眼睛，表明这蛇杖是指兽医的。
中国科学院植物研究所品牌，标识中三角形的两条边代表宏观与微观两个研究领域，底边代表大地。中间的植物代表植物所由4个研究中心和一个植物园组成，三角形及其中植株代表高新技术。
中国科学院上海微系统与信息技术研究所品牌，中国科学院上海微系统与信息技术研究所，英文名称Shanghai Institute of Microsystem and Information Technology ，简称SIMIT。 从形状上看，所标是用四条弧线叠加构成的动感形态，象征着有序的结合、信息波的无限扩展，给人有无限的想象空间，突出体现了上海微系统所科研人员开拓进取、乐于探索、勇于创新、不断攀登科学高峰的理想追求。四条弧线表示作为中科院高技术研究所的科研人员，在社会主义和谐社会建设进程中，始终明确自己的定位、发展目标及应有的贡献。 从色彩上看，蓝色是指蔚蓝的天空和湛蓝的海洋，表示上海微系统所科研人员在科学的殿堂里上天搏击、下海遨游、乘风破浪、不断攀登高科技领域尖端科学的气魄。蓝色又表示平和、朴实，反映出上海微系统所科研人员脚踏实地、严谨务实的科学精神。 从整体上看，整个设计体现了上海微系统所建所来凝聚出的“团结、高效、严谨、创新”八字所风，四条弧线的紧紧叠加和开放式的伸展，表示作为微系统与信息技术研究所的职工在从事科研活动中，团结协作、继往开来、与时俱进的精神风貌。色彩由深变浅，体现出了科研人员力求变革、努力探索科学奥秘的不懈追求以及一步一个脚印、循序渐进、扎实的工作态度。
中国科学院南京土壤研究所品牌，1、圆内由“ISSCAS”中的三个“S”组成，如腾飞的大鹏，一气呵成，喻指土壤事业蒸蒸日上； 2、中间反白部分是“Soil Science”中的两个“S”,指明了我所主要研究内容－土壤科学； 3、上半部分自然绿和下半部分土黄色密不可分，暗示黄土地上的盎然生机，背景为淡蓝，喻指大气圈，又似海洋。 这样就把我所全部研究内容：土壤、大气、水、植物等包容在里面。
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